FluxMed é um sistema integrado de gerência de dados de experimentos de proteômica. Experimentos de gel bi-dimensional, cromatografia líquida e espectrometria de massa são gerenciados. Além disto, FluxProteômica armazena o relacionamento causal entre os experimentos, permitindo ao pesquisador identificar quais experimentos são relacionados a quais outros, simplificando o processo de experimentação e de controle de erros experimentais. FluxProteômica também permite a conexão do sistema com bancos de dados existentes na Internet para fazer a identificação da amostra de forma automática sempre que possível.